Fw 58 A-0 - civilná modifikácia pre prepravu 6 osôb, vyrábaná v rokoch 1936-1937 v počte 10 ks. Fw 58 A-1 - civilná verzia pre výcvik lietania naslepo a pre výcvik radistov, vyrobených 14 ks v roku 1937
Fw 58 B-0 - vojenská ozbrojená verzia s presklenou prednou časťou a guľometom v nose lietadla. Fw 58 B-1 - cvičná verzia bez výzbroje, 50 ks Fw 58 B-2 - cvičná ozbrojená verzia, 119 ks Focke Wulf, 119 ks Fieseler, 165 ks Gotha a 87 ks MIAG, Fw 58 B-3 / BW - plaváková konverzia vychádzajúca z prototypu Fw 58 V9, 2 ks
Fw 58 C-0 - verzia pre výcvik pilotov a rádiotelegrafistov, bez prosklené přídě, predsériová verzia v počte 6 ks Fw 58 C-1 - verzia pre výcvik pilotov a rádiotelegrafistov, 34 ks Fw 58 C-2 - verzia pre výcvik pilotov a rádiotelegrafistov so zväčšenou kapacitou plaivových nádrží, 81 ks u Focke Wulf, 120 ks u Fieseler, 155 ks u Gotha a 157 ks u MIAG Fw 58 C-3 - plaváková konverzia s motormi Hirth HM 508D (280 hp), 2 ks
Fw 58 D-1 - diaľková verzia vyrobená v roku 1939 (W. Nr. 2125-7) pre firmu Zeiss, 4 ks
Fw 58 E-1 - testovacia, resp. meteorologická verzia vychádzajúca z Fw 58 B-2, 1 konverzia Fw 58 E-2 - 12 ks séria vychádzajúca z Fw 58 B-2, určená pre prevádzku v tvrdých zimných podmienkach (lyžový podvozok), Fw 58 F-1 až F-7 - malé série upravených Fw 58 C-2 pre dopravné účely Fw 58 G-1 až G-3 - sanitná verzia, 17 ks Focke-Wulf, 5 MIAG Fw 58 H - experimentálna modifikácia s trojkolesovým podvozokom a motormi Hirth HM 508 H (260 k) Fw 58 J-1 - vzorový, spojovací letoun, 1 ks Fw 58 K-1 - exportní průzkumný a lehký bombardovací Fw 58 K-2 - víceúčelová varianta stavěná v Brazílii, 25 ks, místní tovární označení Fw 58-V9 Fw 58 K-3 - víceúčelová varianta pro Čínu, 1 ks Fw 58 K-10 - 6 neozbrojených B-1 prodaných Turecku Fw 58 KA-2 - pro Maďarsko, 10 ks Fw 58 KA-5 - 2 ks jako vzorové pro zavádění výroby v Maďarsku Fw 58 KB-2 - 2 ks pro Bulharsko Fw 58 KB-3 - 4 ks Fw 58 KE - víceúčelové Fw 58 KJ-1 - fotogrammetrický stroj pro Hansa Luftbild Fw 58 KL-1 - transportní pre Lufthansu, 2 ks Fw 58 KL-2 - lehký dopravní pre Lufthansu, 6 ks Fw 58 KN-1 - lehký dopravní pre Lufthansu, 2 ks Fw 58 KO-1 - fotoprůzkumný, 1 ks Fw 58 KP-1 - konverze z C-1, ke zkouškám radiostanic
